Kontrole będą odbywały się na różne sposoby – według projektu resortu finansów. Obejmą m.in. przestrzeganie prawa podatkowego i celnego, lecz także wielu innych przepisów, m.in. dotyczących transportu, gospodarowania środkami publicznymi z budżetu UE. Do nowego typu kontroli nie będą miały zastosowania obecne przepisy o swobodzie działalności gospodarczej.

Będzie działał także wywiad skarbowy. Ma inwigilować podatników m.in. poprzez obserwację i filmowanie w razie uzasadnionego podejrzenia popełnienia przestępstwa lub wykroczenia skarbowego. W przypadku największych przestępstw (ponad 50-krotność średniej krajowej) przewidziano kontrolę operacyjną, np. nagrywanie rozmów, sprawdzanie korespondencji. Skarbówka uzyska także uprawnienia do stosowania środków przymusu bezpośredniego.

Zmiana jest związana z rewolucją w służbach. W miejsce administracji podatkowej, celnej i skarbowej powstanie jedna Krajowa Administracja Skarbowa, która przejmie uprawnienia tych trzech organów. Kontrole prowadzone obecnie przez UKS-y będą realizować urzędy skarbowo – celne.