Jeśli oryginał faktury wystawiono i przekazano kontrahentowi na papierze, dokument musi być przechowywany w takiej właśnie formie – orzekł organ skarbowy. Zdaniem dyrektora Izby Skarbowej w Bydgoszczy (interpretacja z 17 czerwca 2010 r., nr ITPP3/443-52/10/JK) przepisy nie przewidują możliwości gromadzenia papierowych dokumentów księgowych jako zapisów elektronicznych i wydruku w razie potrzeby. Przedsiębiorcy muszą przechowywać faktury w takiej postaci, w jakiej wystawiono oryginał dokumentu. Oznacza to, że na dysku komputera wolno zapisywać tylko dokumenty wystawione i przekazane w formie elektronicznej. Takie faktury można przesyłać odbiorcy mailem, przekazać na płycie, pamięci przenośnej albo innym nośniku. Muszą mieć podpis cyfrowy.